上海交通大学医学院是全国临床教学资源最丰富的医学院校，也是教育部本科教学工作水平评估“优秀”学校。2012年入选教育部第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，并担任上海市卓越医学教育计划专家组组长单位。

医学院目前设有8个本科专业（临床医学、口腔医学、儿科学、生物医学科学、预防医学、医学检验技术、护理学、食品卫生与营养学），其中临床医 学、口腔医学、医学检验、护理学为国家特色专业；临床医学八年制（法文班）与（4+4硕博班）、儿科学（“5+3”一体化培养）与临床医学（五年制 ，英语班）是医学院的特色班级。2015年以培养生命科学领域卓越领军人才为目标，新增生物医学科学专业。

医学院以培养卓越医学创新人才为目标，始终践行“将一批今天优秀，极具创新潜质的学生能够和不断超越自己，极具创新思维的优秀老师合在一起相互激励，共同超越，使我们的学生更加优秀，使我们的老师更加卓越，产生使学生和老师都终身受益的创新能力和智慧”的教育教学理念。

交大医学院本科人才培养遵循医学教育规律，注重更新教育理念，改革教学内容、教学方法和课程体系，将医德教育贯穿医学教育全过程，不仅注重医学知识传授，更注重激发学生的专业兴趣和科研思维。医学院通过不断实施PBL、CBL、RBL等以学生自主学习为主导的教学方法改革，明确学生在教学中的主体地位，强化医学生医德素养和临床实践能力的培养，实现了临床各学科间知识有机整合，基础与临床医学知识的整合，理论授课与临床实践的整合，完善以能力为导向的形成性与终结性相结合的评价体系，加强医教结合，强化临床实践环节，增加基层见习，严格临床实习过程管理，实现早临床、多临床、反复临床，培养具有系统的医学基础知识和初步的临床能力，具有终身学习能力和关爱病人、尊重生命的职业操守，能不断追求卓越的高水平医学毕业生，形成具有上海交通大学医学院特色和优势的本科医学人才培养模式。

医学院持续深化国际合作，注重对外交流，医学教育国际化水平不断提高。已与19个国家和地区的63所大学及科研机构展开了广泛的合作。聘请了200余位国外专家作为学院的名誉教授、顾问教授和客座教授。临床医学法语班是中法两国政府间重点教育合作项目，也是交大医学院和法国医学院校之间历史久远的高水平合作延续。30多年来，培养了一大批优秀的医生，成为临床、科研、教学的领军人物和骨干力量。2013年10月学院与渥太华大学医学院签署的《上海交通大学医学院渥太华大学医学院合作协议》，成立“上海交通大学-渥太华大学联合医学院”，2015年起正式开始招生。实现国际合作医学办学由项目化到系统化的重大转变。