疫情发生后，熊维宁主任积极参加医院的防控工作，担任医院和黄浦区防控专家组成员，参与疑似病例的筛查和上报工作。医院组织上海市援金山公卫医疗队时，第一个主动报名参加。得知开始组建上海市援鄂医疗队的消息时，第一个主动报名，参加了上海市第一批援鄂医疗队并于大年三十晚上出征武汉，成为最早到达武汉的地方医疗队队员之一。

到达武汉后，被任命为医师组副组长，进驻武汉市金银潭医院后，主动要求进入重症病区工作，白天都守在病区，夜晚主动承担所有的三线班，病区有事随时接听电话，随叫随到。遇到气管插管等相对危险的操作积极主动上前，并承包所有的急诊插管。开始工作的头几天防护镜等防护用品不足，主动将防护镜让给同去的队友，将危险留给自己。

在重症病区的医疗管理工作方面，采用公平公开公正的方法科学地进行医疗组人员的划分，病区值班的安排，使来自52家不同医院的医生能够有序的开展医疗工作。医疗组的划分和排班表的推出使所有医生均无任何异议，促进了医疗队的团结。病区排班规则还向其他医院提供借鉴和帮助。

在队内进行了多场学术讲座，同时还参与其他医院的医疗指导工作、特殊病例会诊等等。此外，还参加多中心临床研究，作为作者之一参与多篇论文和指南的撰写。

接受多家媒体的采访和节目制作，包括上海电台、东方卫视、湖北卫视、长江日报、呼吸界等等，特别是每天早上7点播出的上海电台话匣子栏目，连续14天播放武汉日记，成为上海市民了解武汉初期防疫工作的重要渠道之一。